Punto estratégico de intercambios europeos, el Puerto ofrece a sus clientes una plataforma logística de primera plana capaz de albergar todos los tráficos, (graneles sólidos y líquidos, mercancías diversas, productos metalúrgicos, contenedores, ro-ro, cabotaje, bultos especiales, etc.).
Se encuentra ubicado en la intersección de dos autopistas (norte-sur, este-oeste), unido directamente a la red ferroviaria europea y gozando de la proximidad del aeropuerto internacional de Biarritz. Es una herramienta al servicio del desarrollo económico regional y transfronterizo.

La red de carreteras, presente en el área del Puerto de Bayona, comprende las autopistas A63 en dirección Burdeos y España, la A64 que une Bayona con Pau y Toulouse. A nivel de Bayona, el promedio del tráfico es de 31.500 vehículos diarios entre los que figuran un importante número de grandes camiones.
  

En las carreteras nacionales los flujos son igualmente importantes: la RN 10 (Nacional 10) cuenta con un tráfico de 19.700 vehículos por día; la RN117, 16.700 vehículos por día. En lo relativo al tráfico industrial, la RD85, conocida como la carretera industrial del Puerto de Bayona registra unos 7.500 vehículos diarios.

A 5 km del Puerto de Bayona y a 10 km del aeropuerto de Biarritz se ha creado el Centro Europeo de Flete de Bayona-Mouguerre cuyo tráfico diario se eleva a 6.000 camiones.
Es un área que comprende 100 hectáreas, de las que 30 ya están equipadas. Los pabellones ocupan 45.000 m2.

Por su tráfico anual y a nivel nacional, el Aeropuerto de Biarritz ocupa el puesto 14. En 2001, unos 790.631 pasajeros utilizaron el aeropuerto. Hay vuelos diarios a París, Lyon, Clermont-Ferrand, e incluso a Londres. En 2001, la actividad de flete representó 534 toneladas.